PEJABAT KETUA PENGARAH

• Pejabat Pendaftar Persatuan Nelayan
• Unit Audit Dalam
• Unit Integriti
• Unit Komunikasi Korporat
• Unit Undang-Undang

PEMBANGUNAN

• Bahagian Perancangan dan Pembangunan
• Bahagian Pembangunan Masyarakat dan Pertubuhan Nelayan
• Bahagian Industri Asas Tani
• Bahagian Pemasaran dan Pelesenan
• Bahagian Infrastruktur

PENGURUSAN

• Bahagian Khidmat Pengurusan
• Bahagian Kejuruteraan
• Bahagian Pengurusan Maklumat
• Bahagian Kawalselia Pendaratan Ikan dan Penguatkuasaan
• Bahagian Kewangan & Akaun